Berdasarkan Keputusan Kepala BAKN No. 212/KEP/1984 Tanggal 10 Juli 1984. dibentuklah Kantor Wilayah II Badan Administrasi Kepegawaian Negara (Kanwil II BAKN) yang berkedudukan di Surabaya dengan wilayah kerja Jawa Timur, Bali, Nusa Tenggara Barat, Nusa Tenggara Timur dan Timor Timor. Selanjutnya dalam keputusan tersebut Kanwil II BAKN adalah Unit Organisasi Vertikal BAKN yang berkedudukan langsung di bawah dan bertanggung jawab kepada Kepala BAKN. Kanwil II BAKN mempunyai tugas melaksanakan sebagian tugas pokok dan fungsi BAKN di wilayah kerjanya.

         Seiring dengan pesatnya perkembangan di bidang kepegawaian dengan bergesernya paradigma dari administrasi ke arah Manajemen Sumber Daya Manusia, BAKN juga melakukan reformasi kepegawaian dengan mengubah BAKN menjadi BKN, Badan Kepegawaian Negara dengan berdasarkan Keputusan Presiden Nomor 95 Tahun 1999 tanggal 11 Agustus 1999. Keberadaan BKN ini diperkuat dengan Undang-Undang Nomor 43 Tahun 1999 tentang perubahan atas Undang-Undang Nomor 8 Tahun 1974 tentang Pokok-pokok Kepegawaian. Dengan begitu maka Kanwil II BAKN Surabaya berubah menjadi Kantor Regional II Badan Kepegawaian Negara dengan Keputusan Kepala Badan Kepegawaian Negara Nomor 59 Tahun 2000 tentang Struktur Organisasi Kantor Regional Badan Kepegawaian Negara.

Tugas Kantor Regional II Badan Kepegawaian Negara, adalah sebagai berikut :

1. Koordinasi, bimbingan, pemberian petunjuk teknis, dari pengendalian terhadap pelaksanaan peraturan perundang-undangan di bidang kepegawaian
2. Pemberian pertimbangan dan atau penetapan mutasi kepegawaian bagi PNS Pusat dan daerah di wilayah kerjanya sesuai peraturan perundang-undangan yang berlaku.
3. Penetapan Pensiun PNS Pusat dan Penetapan Status Kepegawaian di wilayah kerjanya
4. Pemberian Pertimbangan Pensiun PNS Daerah dan Penetapan status kepegawaian di wilayah kerjanya
5. Penyelenggaraan dan pemeliharaan jaringan informasi data kepegawaian PNS Pusat dan Daerah di wilayah kerjanya.
6. Penetapan Pemindahan PNS antar daerah Provinsi atau antar Daerah Kabupaten/Kota dan Daerah Kabupaten/Kota lain Provinsi.
   

Berikut Nama Pejabat dan masa jabatan Kepala Kantor Wilayah II BAKN / Kantor Regional II BKN yang pernah dan sedang menduduki sebagai Kepala Kantor di Regional II Surabaya  :

1. Drs. Soediman (14 Juli 1984 - 21 Juni 1988)

2. Bambang Sugeng, SH (21 Juni 1988 - 17 Januari 1995)

3. Drs. Rafael Djari (17 Januari 1995 - 13 Juni 2001)

4. Dr. Sulardi, MM (13 Juni 2001 - Nopember 2006)

5. Drs. Murgiyono, M.Si (2 Pebruari 2007- 10 Agustus 2008)

6. Yulina Setiawati N.N, SH, MM (10 Agustus 2008 - sekarang)